長期推動廢除核武器的日本 NGO 團體「和平船」(Peace Boat)高級成員兼國際廢除核武器網路(ICAN)共同主席川崎哲接受《德國之聲》採訪時指出,對日本來說,非核三原則是一項「根植於全國共識的基本國策」,對於日本政府可能修改相關原則的報導感到十分震驚。
同時,日本原水爆被害者團體協議會(Nihon Hidankyo)也於 20 日發布聲明,對執政黨試圖推翻非核三原則的行為表示「強烈抗議」。該聲明認為,廣島、長崎的核爆倖存者「無法接受核武器被帶入日本,或是讓日本成為核戰基地、核攻擊目標的決策」,堅決反對政府修改非核三原則。
另一方面,前日本首相、現任日本立憲民主黨黨魁野田佳彥也公開針對修改非核三原則表示反對,強調日本應該是「帶頭推動廢除核武」的國家之一,承諾將帶領立民黨「抵制任何可能改變非核三原則的企圖」。
日本《每日新聞》也於 19 日發布社論,針對高市政府可能修改非核三原則一事進行批評,認為相關行為可能導致日本在邁向和平國家的道路上開始倒退,「高市早苗若繼續以她的個人觀點魯莽前進,將可能讓日本留下長久的傷痕」。雖該社論坦承,日本當前的安全環境與數年前相比已變得更加嚴峻,但該社論強調,忽視理想的行為,將抹滅日本「近幾十年來的廢核努力」,並引發周邊國家的擔憂。