原因主要有三点。
第一，画风。
虽然我们总吐槽青山笔下帅哥，美女都长一个样，但是客观的说，《柯南》中的人物确实比《金田一》更加美型。
也许有人会说“推理漫对画风没那么高要求”。说的没错，但是这两部漫画不是单纯的推理漫，而是“推理+青春”。在青春部分，《柯南》领先了一截。
有了良好的画风后，青山就开始在角色CP上做文章了。虽然青山本质上还是个“纯爱战士”，尤其是“青梅竹马控”，但是依然在作品里给各种角色设置了很多CP剧情。这也成了《柯南》除了主线，推理外的第三大看点。
天树和佐藤并不想在这方面有多少深入。从剧情上说，绫香上位的可能性比哀大100倍（虽然都不高），但是在CP党争方面，《金田一》连《柯南》的尾灯都看不见。
第二，配角的塑造。
《柯南》和《金田一》都是单元剧模式，但是《柯南》有主线，有CP，更有人气配角，他们的人气一点都不比柯南，兰低。
比如“大阪黑鸡”服部，“子弹拐弯”赤井，“日本战狼”安室等。要知道这几位身后还都带着后援团，赤井一家都是人气角色，安室透的死亡同窗也很有看点，服部的CP党争最近甚至起了争议。
可以说，《柯南》在柯南与兰之外塑造了一大堆有魅力的配角，除了前面提到的还有灰原，毛利，圆子，目暮等，更别说还有从隔壁没事来客串一下的怪盗基德，甚至就是“帝丹三傻”的三个熊孩子，也是塑造的颇为深入。
在看《金田一》这边。真正撑得起剧情的配角只有剑持，明智，高远三个人。甚至剑持在大部分时候也就是个发任务的NPC。
很多配角都可以深挖，但是作者都不愿去做。比如五木，这个角色的潜力是非常大的，但是天树也只是在案件中提了一下他的中年恋情（然后反手把他的CP杀了）。至于其他的，比如二三，佐木都是工具人，更别说佐木一代还死了。插句嘴，之前看有人总结如何在侦探小说里活下来，说要第一时间和主角搞好关系。说这话的人明显就没看过《金田一》，金田一身边就没有免死金牌，甚至他的同学个个都是人才，要么被杀要么杀人。
甚至是绫香这个当之无愧的“女二”，都没办法撑得起独立剧情，对比《柯南》那边的灰原哀，差的太远了。是绫香没剧情深度吗？当然不是。从绫香登场（雪夜叉）到揭秘身份（塔罗山庄），再到疑似母亲登场（绑架），绫香是有一个完整的剧情线索的。但是后续呢？没了。这就要说到《金田一》的最大软肋了。
第三，《金田一》没有主线。
很多人都会强调，论案件的精彩程度，《金田一》完爆《柯南》。我也这么认为，都不说推理的严密和手法的精妙，就说恐怖这一点，《柯南》就不够给《金田一》提鞋的。
《柯南》三大童年阴影：图书馆，蓝色古堡，绷带怪人。我现在事后看，前面两个的恐怖程度也就是《金田一》的平均水平，绷带怪人算得上中上。
我最早接触柯南是小学，电视上播的前101集，后来中学又看了一些漫画，没有追（当时也没条件），但是有了就会看。而《金田一》我最早接触就是高中了，看了电脑山庄的小说，真正补是大学。结果我一个大学生在自习室看《金田一》漫画被吓到不行。后来假期在家里补动画被吓得一惊一乍，真的恐怖。
既然单元剧《金田一》完胜，那为什么漫画人气不行呢？答案是主线。柯南有明确的主线：黑衣组织。从第一个案件柯南变小开始，黑衣组织就登场，并且逐渐在单元剧中编制出一个完整的主线。现在《柯南》的日常案件已经稀碎，不少人看《柯南》只看主线相关，虽然现在感觉主线也碎了。但是毕竟有主线。
《金田一》呢？完全没有主线。有人说主线是高远？拜托，高远除了没事策划几个案件外，干过什么连续性的东西吗？那些高远策划的案件，你把高远去掉，一点都不影响剧情。你去把《柯南》主线的琴酒去掉试试？
没有主线意味着你可以随时放下。因为再拿起来的时候不用担心跟不上剧情。这就让《金田一》不容易产生牢固的粉丝。就像我，37岁事件簿看了前两个案件后也扔下了，想着有空再看，到现在都没看。要知道，37岁事件簿，天树还搞了个“十二主神”这种疑似主线呢。
第四，进入中国市场的时机。
三个原因有四条不是很正常吗？第四条是中国观众特供。
其实在日本，早期《金田一》才是更有人气的一个，甚至《柯南》的出现都有蹭热度嫌疑，疑似是小学馆眼馋这个讲谈社台柱的跟风。即使在《柯南》火了以后，金田一也和柯南并称“东京双煞”，在日本影响力不低。
然而在中国，金田一翻10倍也赶不上柯南。究其原因，就是时机。《柯南》在上世纪末引进中国，也就是在99年前后。而《金田一》漫画的第一部完结于2000年，当时已经过了人气最高的时代。
两部作品最初的动画制作时间差不多，但是中国电视台选择引进了《柯南》，使之成为中国观众最早接触的侦探漫画。实际更早的《金田一》反而成了后来者。
不过我倒是能够理解电视台的选择，就《金田一》第一部动画的那些剧情和名场面，要是当时引进，那就不是中国观众的童年阴影了，而是直接从根本上消灭掉中国看侦探漫画的群体了。
等到现在网络媒体兴起，当年看《柯南》长大的80，90后自然成为了主力军。童年加持下，很多“云观众”（比如每年只看剧场版的）也只知道《柯南》压根没听说过《金田一》。毕竟，真正的推理漫画粉丝是很少的。
我是希望b站能把《金田一》动画的版权买下来，我是挺想在弹幕下回顾《金田一》。《金田一》的童年阴影（或者说是青年阴影？）可太多了，像是学校不可思议案件的回眸一笑，悲恋湖的斧王，雪夜叉的摄像机，墓场岛的白骨，魔术列车的碎尸等等。真不知道爱奇艺守着这个人气不高的动画干啥。