樓上列舉的理由不少了，我再列舉一個很多人可能意識不到的……
就是東海道新幹線早就已經已經飽和了
東海道新幹線現在最高的尖峰密度是每個小時15班，平均密度4分鐘。與之相比的是，京滬高鐵雖然密度也很高，但是尖峰密度也只有每個小時11班=5分半。
但是京滬高鐵在部分路段（上海－南京，北京－天津，濟南－德州）是有另一條並行高鐵線的，東海道新幹線目前並沒有這種奢侈。
應該說，東海道新幹線飽和的原因和沒有並行線的原因有點關係。因為需要服務除了東名阪圈主要車站以外的車站，こだま和ひかり都需要達到一定的密度。JR東海也確實做到了——我上面提到的每個小時15班裡，4班是こだま和ひかり。
然後のぞみ就只有可憐的11班了，跟京滬差不多（如果不考慮のぞみ的priority比大部分京滬的車要高的話）。加上本來東京－名古屋－大阪的客流就不少，於是就飽和了。
所以JR東海作為一個私企才會選擇用自己借到的錢（而不是學鐵總把國有資產抵押才能借到錢）修中央新幹線，因為修的費用再貴都賺得回來。
等中央新幹線的完整版修通到Shin-Osaka，估計HND-ITM的使命就可以結束了。


作者：知乎用戶
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作者：Wakana Seytiliz
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謝邀。
姑且認為提問中的線路僅僅指的是羽田-伊丹
線（HND-KIX，NRT-KIX/ITM也是有航班的，只不過不構成「高密度，寬體機的條件」。
為什麼高密度飛機班次和新幹線能夠共存呢？因為兩種交通方式各有其獨到之處和顯著優勢。
還是先說說價格問題。
新幹線希望號
單程（指定席）是14650（rmb900），JR東海的付費會員可以拿到部分列車的早購買折扣（該線路最多15%），不適用往返折扣。
航路（ANA/JAL 注意僅此兩家運營羽丹線），這裡拿我航ana舉例子，當日單程25000（rmb1500），提前優惠單程最便宜12890，往返23190，收費改簽。
有一個說飛機比新幹線便宜的純屬xx，要便宜的人要麼做站站樂
「回聲」，要麼普速列車，要麼夜行巴士。
價格問題和後面的論述有不少關係。
So Why？
先來講講各自的優勢。
新幹線快，靈活，在靈活的條件下更為便宜。
乘坐希望號從東京到新大阪2h33min，新大阪到梅田也是一站路；而相對的，飛機需要花費3小時多的時間（航程1h10min 東京-羽田30min左右 伊丹--梅田30min左右 還要計算登機下機的時間，沒有實名制和安檢的日本新幹線不需要計算冗餘）。相差半個多鐘頭，對於出差一族還是挺痛心的。
新幹線
的班次也要多出很多（最多一小時15班上京，飛機目前撐死30分鐘一班，差距還是挺大的）更何況，對於商業人士來說，返程的時間會有不確定性，到底是隨便挑個新幹線還是硬着頭皮改簽，大家自有選擇。（對 就是隨便挑新幹線，時間充裕點上機器劃一張指定座）
飛機在一定條件下價格誘人，而且有成熟的常旅客制度
。
為什麼這麼說呢？熟悉日本國內線機票體制的人可能會看到「株主優待」的選項。比如在A公司的社員，A公司與ANA有了協議，其便可以申請優待券
來使用優待價格（這條線長期在10000出頭），這樣的話新幹線就不會被考慮了（據我所知JR東海很少有協議）
同時，如果有往返日期均很明確的情況，選擇飛機票也更划算（根據上文列出的價格，便宜的5000多日元能換來挺豐盛的一日三餐了）。常旅客計劃
也有重要的影響，兩大航空的積分都可以花在各類領域，出差的時候多攢點分豈不美哉。
除此之外，還有一些其他的因素。
高密度的新幹線不只是服務於東京和大阪！沿線的名古屋
、京都也是乘降人數較多的大站，而兩地前往首都乘坐飛機都很不方便；首都圈外部的車站（小田原
、熱海）也是如此，快速達到大阪/東京也只能選擇新幹線。
高密度的航空也針對了大規模的轉機客流。日本的國內線航空樞紐毫無疑問是羽田，而大阪前往本北/北海道地方從羽田走也十分方便（例如大阪至庄內
地區做火車巴士要八小時以上，合理的羽田轉機只要4小時左右；東京到紀伊半島
需要新幹線+特急的長時間旅途，從伊丹轉機飛到紀伊白浜
能省一半時間）；國際線也是如此，住在大阪的人羽田下飛機不可能轉新幹線（關西的遠程航班比羽田少很多）。
當然最重要的是足夠的客流量和帶來的利益。就像京滬之間也有大密度高鐵和大規模航空存在一樣。日本大規模使用寬體機
也是這個考慮（當然羽田航線緊張也是一個因素。）
不過京阪大戰
毫無疑問是一件幸事。它促使了新幹線放棄低效率的站廳候車，擁有了世界第一的效率（東海道新幹線
東京站只有6條道，4-6分鐘一班）；它也促使了日本航空業提升服務，改變票價機制，提升安檢及進場效率（提前15分鐘登機）大幅度保持高準點率。
（這麼看CRH和三大航在京滬線上是互相比爛？……）
手機碼字 
請多指教
回應一下下面三位答主

隔天定就是15000以上
提前一個月旅割28也要10000出頭
不要拿國內機票網站來說事，因為explore japan
確實賣的便宜，但是日本人又用不了；同樣我用pass還能免費新幹線（這回又出來一個日語網站）這怎麼算。
算出來3000多的可能是成田飛關西。陸地交通大概也差不多和飛機票一樣貴了。如果dalao是羽田關西那到有點吸引力，請給我LCC會名字我去官網查價格（3000多？算了吧）
何況沒有人提到JR東海的EX預約也可以早買打折的，平峰時段提前定Hikari（二等列車）的綠車（一等座）可以壓到9800（你們自己去EX驗證）。既然dalao們都找到了機票能到3000的網站，那麼不妨去新宿西口
的棚戶群看看賣7000的東京岡山
新幹線車票。
最可笑的是還拿「私營化」做笑點，要是CRH經營這條路況條件糟糕的線路，再放上實名制和安檢機，ANA和JAL可真是笑開懷了。
當然JR東海
的名聲沒好到哪裡去。

某知乎用戶：

謝邀！這個問題你不能用計劃經濟的思維理解。
JR東海和航空公司一樣都是民營企業，彼此是競爭關係，資源配置由市場決定，而不是某個人憑空拍腦袋決定了「最優配置」。

1. 東京大阪間航班雖然不少，但也得幾十分鐘一班。新幹線是幾分鐘一班，一列新幹線席位數又是一架飛機的幾倍。所以，航班席位數實際只有新幹線的零頭。
2. 坐飛機的也有特定原因。比如外國到東京轉機去大阪的，出發或目的地離機場比較方便的，有航空里程的等等。
3. 也有些航班是比如東京-大阪-台北這樣的


作者：szbd
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什麼傻鼻兒玩意兒：


新幹線這麼貴，飛機這麼便宜。
從客流看，有客流需求的情況下使用寬體客機對於航空公司利潤更高，並且可以降低票價與鐵路競爭。畢竟首都圈到阪神圈在四小時堡壘以內，航空沒有絕對優勢的情況下自然是為了票價越低越有競爭力。

姜三三：

14650円大概是800多

在客流量較密集的航線運用寬體機在運輸相同數量的乘客（注意前提客流量大）的飛行次數少，所需時間少，成本低，航空公司何樂而不為呢？
並且日本這麼做早就是傳統了，例如日航123次空難中的波音747SR-100就是特供日本的多客座短航程版747，通過減少油箱，增強起落架強度，使用單級客艙等措施滿足日本市場的需求。
至於在鐵路與航空搶奪市場的今天，＂三十六計，唯快不破。＂，在鐵路運行速度趕超航空之前，速度永遠都將是航空業的優勢。
當然啦，坐飛機還能看小姐姐嘛


作者：張子豪
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珍寶女王：

當年日本還定製了波音747-100SR飛這條線呢，這條線飛機快些，55分鐘。

吃手​：

東京到大阪客流量大
新幹線價格可以到機票2倍多。
別看東京到新大阪新幹線285kph只需要跑2個半小時，票價能到一萬4日元。我去日本的時候匯率1比不到16，到大阪新幹線將近900塊錢，當然了我有JRPass倒是還好，只不過不能坐希望號就是最快的那個車。
東京到大阪新幹線價格和北京到廣州的高鐵差不多，所以說CR多便宜吧，還更快。