然而，藏王树冰的体型逐年缩水，山形大学名誉教授柳泽文孝领导的研究团队比对分析自1933年以来从相同角度拍摄的照片，结果显示树冰的厚度大幅下降。1930年代树冰宽度可达5米至6米，数十年后缩小至2米到3米，2019年以来仅剩50厘米，部分甚至呈现细针状。
柳泽指出，气候暖化与森林生态衰退导致树冰萎缩，冰雪覆盖的冷杉（Abies mariesii）自2013年起遭遇严重的树蛾啃食，2015年又滋生小蠹虫，导致大量树木蛀蚀枯尽。山形县政府数据显示，约2.3万棵冷杉死亡，占该县林木总数的20%，树木枯萎后，枝叶减少，冰雪难以附着，树冰大幅萎缩。
此外，气温快速上升也让树冰的形成环境恶化，2019年一项研究指出，山形市12月至3月的平均气温在过去120年间上升约摄氏2度，积雪形成的最低海拔也随之上升，且积雪持续的时间也愈来愈短。
东京大学环境学家伊藤昭彦表示，日本高山地区升温速度高于全球平均，“独特的景观正因气候变迁而消失，虫害蔓延等因素可能降低森林的生长速度和密度。若升温明显加剧，未来在比往年更温暖的冬季，树冰可能完全无法形成”。
树冰不仅是自然景观，也是地方观光产业的支柱。面对这场危机，山形县2023年成立“树冰复活委员会”，结合各方力量共同推动森林复育，林务单位已移植逾190棵树木到山顶区域。不过，冷杉需要50年至70年才能发育成熟，复育俨然成为一场需要长时间投入的跨世代工程。
山形县立村山产业高中学生曾目睹树木伏倒或枯死，学生自2022年起与林业局工作人员一起前往藏王山采集幼苗，带回学校插枝培育，帮助藏王山重获新生。学生谷合佳音说：“树冰被称为雪怪，因为世界上没有任何东西长得像它们一样，我希望全世界都能有目共睹，见证日本独特的自然风光。”
