歌劇院新殺人事件

唯一一部阿一聲優是由山口勝平擔任，動畫版改為松野太紀。
結城英作未登場，改為能條光三郎私人醫師佐伯京子。並加入新角色房地產社長武村英三。
飯店工讀生江口六郎在小說裡是美歌同學並暗戀她，劇場版只是普通的工讀生。
能條聖子在劇場版只是光三郎未婚妻，保留舊姓真上寺。
小說裡美歌是遭侵犯後自殺，劇場版改為喝下藥物而在上台前出醜並被拍下。
小說裡並沒有燒燬劇場，此段為劇場版加上。
追加加奈井裡央為共犯的情節。

歌劇院最後的殺人事件

原作原名為歌劇院第三次殺人事件。
響美土裡、白神海人、三鬼谷巧未登場。
刪去劍持警部被兇手綁架的劇情。
未提起黑澤和馬的任何事情，沒有魅影留下的日記。
湖月玲於奈沒有恐火症。
主張城龍也為兇手的人為影島十三。
城龍也自己要求在歌劇院過夜，原作是白神提議。
冰森冬彥是到歌劇院才認識，依然為現役演員。
魅影的面具在海上被發現，原作則是在地下迷宮裡發現，不過讓大家以為魅影投海身亡，就與第一次歌劇館事件相同。
指控兇手的證據是鞋底附着煙囪的鐵銹。
刪去湖月疑似被綁架的情節。
刪去大批冷凍雞肉散落一地的情節。
原作中霧生銳治是死於樹海裡，動畫版是被推落懸崖。
原作中城龍也與響美土裡曾交往過，動畫版則是繪門泉。
沒有出現霧生遺物的圍巾以及手帳。
追加霧生在地下迷宮牆壁上留給玲於奈的信息。
前兩次歌劇院事件的兇手形象沒有出現。
冰森冬彥與影島十三的性格變得較惹人厭。
沖泡花草茶的人變為湖月玲於奈。
事件開頭沒有金田一騎腳踏車前往碼頭一幕，結尾時沒有明智警視來電通知高遠逃獄。

吸血鬼傳說殺人事件

原作為敢死之行後收到高遠的信而展開旅行，動畫版是溫泉之旅途中在Ruins做停留。
流山森太郎及貴船葉平未登場。
二神及海谷的姓名及性別皆變更，二神育夫改名為二神郁子，而海谷朝香改名為海谷政夫。
海谷為緋色景介所救未遭兇手殺害。
追加美雪與辻由利亞相似的設定。
金田一詢問人體抽出多少血量在安全範圍內的人選改為海谷。
湊青子與金田一並沒有推理對決。
原作是金田一誤闖浴場看到打算入浴的美雪而察覺兇手的不自然，動畫版是不小心看到美雪在換衣服的場景。
做為證物的美雪頭髮是劍持從湊青子口袋中取出。
事件結束後金田一並沒有騎腳踏車離開。

殺戮的深藍（劇場版）

藍澤茜是阿一和美雪的學姐會使用武術反抗過恐怖分子。
楊小龍沒出現，劇場版中二三有跟阿一和美雪隨行。
茜的其中一個義兄浩一被汽車炸彈炸死，並非於沖繩飯店遇害。
阿一被襲擊打昏後被扔進水槽。
藍澤秀一郎把深藍的島嶼蓋飯店的原因，只是因茜年幼時童話般的玩笑。
五木陽介通知劍持說，阿一在飯店被挾持。
恐怖分子的女性成員巫琴沒出現在挾持飯店中，直到恐怖分子等人被捕時與明智照過面。
兇手改為周防武，與原作不一樣

黑魔術殺人事件

海崎深夜未登場。
黑瓜鬼門登場與火祀兄妹爭吵的順序調換。
高遠退場的方式，原作為使用替身，動畫版則是消失在庭園迷宮中。