金田一少年敢死之行

场景由香港改为日本本土的神奈川县，同时事发地点由酒店废墟变更为深山中，原作教授纵火焚烧酒店的设定亦被取消，
原作第一名被害人是被高远遥一假扮的神父用毒酒毒死，电视剧中改为在洞窟中被狩谷纯用长矛刺杀。
周龙道一角改名为道场龙，南丽晶改名为南丽子。
狩谷纯被高远遥一用毒箭刺伤入院的设定取消，改为金田一手臂被划伤。
删除了速水玲香、五木阳介、李波儿刑警(原为孙耀威演出)、杨小龙(原定竹内凉真)、江建一、香蝴蝶，增加了友利圭的角色。
明智警视的部分由剑持警部取代。
松冈修治、四之宫彻和藤井文香收到恐吓包裹原本是神山康介的右手，改为神山康介的照片。
原作被刺杀的明智警视没死的讯息告知金田一是用报纸告知，改为被刺杀的剑持警部没死的讯息是透过真壁诚用电视新闻告知金田一。
原作的表演者的名称是面具人，电视改为川上刚史。
金田一去看魔术秀的原因是五木阳介告知他讯息而一起去，电视改为推理研究部收到催眠秀招待券。
原作高远诈死逃走，但之后伪装剑持警部出境而被逮补，电视版改为伪装某一刑警后被揭穿直接逃走。
少了凶手帮金田一擦拭脸上番茄酱的手帕成了之后的关键证据。
金田一看照片发现狩谷纯(道场龙)实际年龄，原作是(香港)领事馆前插著英国国旗，日剧是老街后方未有事发的饭店建筑。

雪影村杀人事件

原作设定为冬天，电视剧改成夏天。
金田一去雪影村原本是要去参加叶多野春菜的丧礼改成金田一要去雪影村旅行。
删除了时光胶囊的剧情。
春菜的死亡原本设定是昨天割腕自杀，电视剧改成一年前服药自杀。
原作凶手偷走上送箭后马上犯案，电视改为偷走上送箭后一年才犯案。
叶多也春菜的死讯原作是岛津匠打电话告知，日剧是到雪影村之后才从其他人口中得知。
佐木跟真壁诚随金田一一同前往雪影村。
金田一推理时跟凶手约定的地点原作是广场的树下，日剧是教室里。
原作中美雪未登场，电视剧则设定为因为金田一在学校和别人讲美雪每天内裤是什么颜色而和金田一吵架、因而没与金田一随行，但结尾仍然出现。

蔷薇十字馆杀人事件

白树红音的角色被删除，改由真壁诚作为火灾幸存者之一，取代白树红音的地位，与佐久罗京为失散兄弟。
小金井睦的角色被删除。
由于原作首名被害人皇翔出场画面过于血腥，电视剧中被改为以死亡面具的形式出现。
原作只有金田一和高远亲眼目睹被害人禅田和服的右袖被扯掉，剧中则是被所有人看见。
谋杀目标之一冬野八重姬并没有直接偷窃蓝色蔷薇之行为，有点路过却被其他当事人拖下水的意味。
原作结尾凶手月读吉赛儿企图用遥控器引爆炸弹炸毁蔷薇十字馆，剧中则是试图自杀。

第5代部分（2022年，道枝骏佑版）

学园七不思议杀人事件

青山千裕一角的造型从短发变成双马尾辫。
不动高中旧校舍的前六大不可思议，分别为“打不开的生物教室”、“手掌爬动的印刷室”、“血染之井”、“刻印死亡的大时钟”、“无底的游泳池”、“魔之十三阶梯”。
不动高中旧校舍的前六大不可思议，从的场为了掩盖真相而编造的，改成学生之间虎扯编造。
不动高中旧校舍的第七件不可思议改成没人知晓真相，后从的场口中得知为“鲜血的音乐教室”。
删除掉原作角色鹰岛友代。
的场在原作兼任推理研究会顾问，本作中纯粹只是物理教师。
推理研究会在原作原为旧校舍的乐器室，本作改为旧校舍的音乐教室。
真壁的小说代笔对象改成龙太。
删除琉璃子邀请阿一进入社团的剧情。
琉璃子发现墙壁之事的契机改成推倒真壁时铁制架子将墙壁砸落碎片。
琉璃子生前所留下的“墙壁藏尸”密码从诗词码变成数字码。
琉璃子生前打电话告知的对象从阿一改成美雪。
因删除掉鹰岛的关系，所以待在警卫室的人改成龙太。
本作删除掉真壁诚解开凶手误导真相用的密室手法。
尾之上遇害的主因改成怒撕贴在藏尸墙壁上的真壁海报后无意间看到骨骸而被杀害。
尾之上遇害前前并未得知樱树琉璃子留下的密码，所以无其解开密码的同时遭到袭击杀害的剧情。
剧情追加真壁先后因樱树琉璃子和尾之上被杀害之事而被当成嫌疑犯的剧情。
美雪被袭击的原因从想撕掉海报变成想破解琉璃子遗留下的密码。
原作中在美雪遭到袭击后，阿一因此颓废丧志直到后面才提起振作，本作中反而一心想抓出凶手。
原作中阿一是透过找到琉璃子留下的档案磁片而破解密码，本作中则是密码文件遭到删除后透过佐木龙太的摄影画面破解密码。
六名遗体的身份从高畑制药的试药对象变成鹰畠建设的建筑工人。
当年六名遗体的死因是服用实验失败的药物致死变成因吸入过多的毒气瓦斯而中毒身亡。
当年遗体的埋藏地点从前六大不可思议所在地点改为旧校舍所在地的地面下。
的场被接露凶手的身份后的反应从原作中为自己狡辩变成坦然地将当年真相说出。
青山的身亡原因从与的场争执中从楼梯坠楼意外身亡变成因发现尸骨的关系而被的场叫来音乐教室惨遭遇害。
青山千裕被认为失踪为七年，本作为十年。
的场在原作中被刺杀身亡，本作中改成受伤活下来后被警方逮捕。
本作中龙太因此案而不再当真壁诚的代笔而自愿当阿一的小弟。
原作中事件后真壁反被鹰岛所控制一切，本作中事件后真壁企求龙太继续当他的小说代笔。

圣恋岛杀人事件

原作凪田空也一角，从男性角色变换成女性角色凪田夏见，职业亦从电视台制作人变换成导游并且曾经是帝王大学医院的护士却因受三名被害者给陷害而被迫离职。
删除掉原作角色奥之木武藏、鬼岛高彦、海星终吾。
阿一等人的钓鱼同行者追加龙太。
三名被害者顺序变更为寒野美火、潮小次郎、影尾风彦。
潮小次郎被卷入大海时跳下水尝试救人的人从剑持变更为阿一。
增加夏见被影尾性骚扰，阿一和佐木两人都不肯上前阻止，最后美雪奋勇掩护凪田的情节。
凶手结尾有告诫金田一说若不想要失去他很重要的东西就不要太沈迷推理。
阿一在事件中对美雪的态度变为较不耐烦，反而是美雪想要利用好这次出游时机和阿一好好相处、佐木对于被阿一冷落的美雪有关切；与原作阿一幻想和美雪有情感突破形成巨大反差。

白蛇酒藏杀人事件

原作角色有镜花的女儿苍叶，但在电视剧版中无此人物。
白神左绀在原作中被刺穿喉咙而死，电视剧版则是被吊死。
镜花原作结果是遭苍叶饲养的有毒白蛇给咬伤中毒身亡的，电视剧则是遭到逮捕。

厕所的花子杀人事件

事件名称完全变动，原作名称为‘亡灵学校杀人事件’。
事件当事人身份从高中生变更为大学生，其中狮子岛的名字从‘隆’变更为‘龙’。
事件发生地点从废旧的学校改为医院。
草太未登场，取而代之的是佐木陪同金田一与美雪前往民宿。
追加佐木拍摄废弃医院周围与办案手法的情节。
试胆大会期间，原作中美雪因为害怕而未实际进入废弃学校的厕所，电视剧则改为阿一、美雪、佐木一起进入废弃医院。
伊能耕平遇害后衣服上被泼红墨水的情节，原作中不知道是谁做的（涉及灵异），电视剧改为凶手泼洒。
原作是在发现伊能身亡前，研太谈及伊能作品的传闻令真纪动怒，电视剧则在之后狮子岛谈及与怀疑真纪杀害伊能因而惹怒对方。
原作结尾是案件数个月后，阿一在准备学园祭期间在图书馆苦于钻研灵异现象，电视剧结尾则是案件结束后阿一和美雪互相买饮料，而佐木错过回程巴士。

金田一少年的杀人

故事背景从长野县改为神奈川县。
删除明智的角色，对阿一开枪的指令由剑持代替。
删除花村姐妹、鸭下明、针生圣典的角色，佣人菊婆婆改为年长男性菊藏，长野县警部长岛滋改为神奈川县凪浦署警部高林登，落语师桂横平改为偶像桂木优里奈。
五木初登场从自由职业作家改为音原出版社作家并设定为剑持友人，因与剑持的关系而愿意出手帮助阿一。
原作中金田一因为美雪被橘给性骚扰怒不可遏，决定用钓鱼竿恶作剧拔下其假发令其出糗；新版电视剧改为优里奈被喝醉的橘性骚扰，而金田一恰好被桂木推到橘面前，橘遂与金田一扭打时不慎掉入游泳池。
阿一开枪的提示，由原作的BB机所用到的五十音密码变更为纸条上用橙汁制作的隐形墨水。
原作都筑替换的近视以及远视眼镜都属于都筑本人，新版的年纪变更为较年轻，远视眼镜为被害者橘所有。
原作都筑需要捐肾对象为其女儿，新版电视剧改为其未婚妻。
原作美雪参与事件全程，新版电视剧则未参与事件本身。

猎头武者杀人事件

事件名称完全变动，原作名称为‘飞驒机关宅邸杀人事件’。自第1代“无首村杀人事件”后再度改编。
原版巽家还有个最小的弟弟，新版电视剧只有出现妹妹，多年前龙之介打算毒害的对象由弟弟改为妹妹。

歌剧院魅影的杀人

事件名称变动，原作名称为‘剧场馆·第三次杀人事件’。
原作歌剧院是在岛上，电视剧是在山上。
删除响美土里的角色。
绘门泉被杀后，原作发现吊灯线切口的是白神，电视剧是金田一。
原作剑持被攻击以及三鬼谷巧被杀是在晚上，电视剧是白天。
玲于奈丢三鬼谷巧的手掌的地点，原作是歌剧院到塔的路上，电视剧是在塔内最底层的楼梯旁。
原作踢到三鬼谷巧遗体的是金田一，电视剧是美雪。
原作发现剑持被关在地下迷宫是在龙也被杀之后，电视剧是之前。
原作剑持在地下迷宫被发现后一直清醒，电视剧发现时清醒但后来昏迷一段时间。
原作在地下迷宫金田一是踩到电池滑倒才发现电池，电视剧是直接看到。
原作先发现城龙也尸体的是响美土里，电视剧是金田一。
删除冰箱食物被弄一地的乔段。
原作遗体是放在剧场，电视剧歌剧院内有间祈祷室，遗体都移至那。
原作金田一想到钥匙手法是看到蜘蛛，电视剧是蟑螂。
原作金田一是在剧场推理并亲自操作吊灯手法，电视剧是在地下迷宫推理，吊灯手法是金田一下指示，美雪跟佐木操作。
原作玲于奈知道雾森被丢在树海是参加节目录影时发现他留下的笔记本，电视剧是听到绘门泉、三鬼谷巧、城龙也三人的对话。
玲于奈放火后，原作金田一是把玲于奈救到地下迷宫深处悬崖边的洞口等火熄再上去，电视剧因为是在地下迷宫放火，所以是救到外面的长椅上。
电视剧中剑持是在解谜篇的中段才知道金田一是金田一耕助的孙子，此设定在播出时被网友、粉丝们批评。