南投县:
921大地震,南投县受创最巨,10多个乡镇市重创,县内的各项设施、经济产业、观光旅游、民众生命财产等都受到重大损失。
集集镇:正好位处震中,台铁集集线铁轨严重扭曲,而集集车站木造站房严重倾斜;位于集集镇市区内的当地居民信仰中心武昌宫梁歪柱倒整座倒塌。
草屯镇:草屯镇公所办公大楼严重受损;全镇受灾以太平路东较为严重计山脚、富寮、南埔、坪顶、土城、双冬、平林、中原、北势、御史等10里;九九峰山头因地震影响而变得光秃一片;草屯商工校舍倒塌毁损。
南投市:中兴新村有5厅处的政府大楼全倒;台汽客运中兴新村站房下陷倾斜;南投酒厂因地震而发生爆炸起火,火势一直烧到天亮才逐渐熄灭,约有四分之一的厂区付诸一炬。
国姓乡:九份二山大崩坍,将近40名村民活埋在难以估计的土石底下,而当地的水鹿场瞬间变成一片黄土,300多只的水鹿也一并遭到活埋;崩落土石并阻塞涩仔坑溪与韭菜湖,形成数个堰塞湖,地形地貌大幅改变;台14线中潭公路多处路基下陷,柑林隧道前后有巨石及树木掉落路面。
埔里镇:约有400多栋房屋倒塌,死亡人数超过180人;埔里镇公所亦倒塌;埔里酒厂因地震而发生爆炸[24];国立暨南大学多栋大楼外墙龟裂;台14线埔雾公路中断,台21线埔里经日月潭至鱼池段路基严重下陷,交通亦中断。
中寮乡:位于双冬断层上,死亡人数178人,虽然并非南投县最多,然而以当年中寮乡在籍人口数对比其死伤人数,伤亡比例可说是全台首位,以受灾比率而言,中寮乡房屋全倒、半倒户数占全乡达82.6%,是震灾的一级灾区;乡内的台电超高压及一次输电铁塔共计18座全倒或半倒,而具输电枢纽地位的中寮超高压开闭所共有34具超高压输电线变压器及47具避雷针掉落损毁。
鱼池乡:日月潭地区灾情惨重,日月潭风景区的地标光华岛(现称拉鲁岛)受损,且岛屿面积亦有缩小;日月潭教师会馆亦被震塌;多处观光饭店旅馆如天庐大饭店、中信大饭店、九龙大饭店等倒塌全毁,其他亦全倒或半倒;不少民宅亦被震毁。根据中央气象局日月潭气象站的纪录,此区水平最大地动加速度达到9.89 m/s²,也就是震中附近水平加速度超过1g(9.8 m/s²),远较日本阪神大地震0.8g为大。
水里乡:大地震对水里乡带来破坏,房屋全倒602户,半倒1265户,全倒、半倒户占水里乡受灾比率达27.6%;新山国小校舍全毁;集集线车埕车站严重受损。
名间乡:车笼埔断层经过名间乡,彰南路上、名间乡唯一的集合住宅社区“上毅世家大楼”921地震时并没有立即倒塌,但却在9月26日早上8点多芮氏规模6.8的余震发生后,前栋倒塌躺在台3线上,并压垮了对面的名间乡农会;地震也造成台电高压电塔倾斜,多处地面起伏变形,并使得集集线铁道弯曲。
竹山镇:有多栋大楼倒塌,最严重为集山路整条路房屋悉数全毁;中国石油公司竹山加油站完全塌垮[24];竹山秀传医院外墙龟裂、慈山医院大楼也受损。玉山新城的住户,因为地震造成山坡滑动,约三十户人家的住宅因而全倒,死亡人数约十数人,其余未倒的皆为半倒房屋。据统计全镇有118人不幸罹难、重伤49人,房屋全倒2711户、半倒2973户,堪为竹山镇历次重大天灾事件之最。
鹿谷乡:凤凰谷鸟园受损,鹿谷国小、内湖国小全毁,全乡一片残破。