死神病院杀人事件

与明智警视之华丽灿烂休假结合，并在同一特别篇播出。
金田一入院的时机，原作是在发现扇谷三郎被杀、警方到达现场之前，动画则是在之后。
凶手从圣正景太郎变更为圣正映子。
圣正映子并非美雪的学姐。
没有美雪曾是篮球社社员的设定。
护士长高泽和子死因从被毒杀改为高空坠落。
删除齐藤一夫（偶像明星爱河翔子伪装）的角色。
追加水岛一夫及其母亲水岛多纪的角色，水岛一夫曾因圣正综合医院医疗事故而死，水岛多纪因而对圣正综合医院怨恨。
追加圣正映子和其他医生抢救突发疾病的水岛多纪的情节。
圣正智明没有被杀，而是被揭发走私人体器官一事后被捕。
雪室忧一并未因为妨碍公务被捕。
原作结尾是金田一追着爱河翔子要签名，动画改为金田一再次挑战吃100盘饺子，虽然成功但是再次因此住院。

金田一少年的杀人

金田一课上做梦的情节，从自己被判死刑改为自己被警方逮捕。
金田一原本就知道橘五柳是谁。
佐木连太郎未登场。
因为动画版佐木龙太未死亡，佐木龙二戏份改为龙太，也没有涉及龙太魂魄的情节。
野中友美询问橘暗号谜底时，向橘施展女色的行为尺度相比漫画收敛。
橘性骚扰美雪时没有丢钱，并且金田一是直接上前阻止，和橘发生推搡、无意间让橘的假发掉下，不同于原作通过钓竿恶作剧让橘的假发脱落。
长岛滋在电车上追捕金田一而打破窗户的时候，原作有开枪，动画改为一跃而下、双脚击破玻璃。
金田一留给明智的关于射击空包弹的讯息，多了一段“这样做必然可以抓出凶手”的内容。
解答篇中金田一解说完“看不见的路”之后才批评长岛警部的办案、谈到凶手因为五木的关系而掌握金田一行踪，以及揭露凶手真实身份。
事件后金田一和美雪并没有到医院探望都筑瑞穗。
动画版没有说明橘的遗作由哪间出版社出版。
原作中金田一直接半开玩笑怀疑五木是否是恋童癖，动画则是五木谈到要收养都筑瑞穗时，金田一和美雪对五木坏笑。

幽灵客船杀人事件

原作是金田一、美雪和剑持夫妇分别来到客船、后来相遇，动画改为剑持为答谢金田一、美雪长期协助破案而邀请出游。
剑持和枝、饭岛优、美里朱美与中村一郎未登场。
新角色时原优登场，她的丈夫命丧于东方号船难。另一个新角色吉田明则是与大泽贵志成为搭讪二人组。
对于警察问话，加纳达也并不若原作那样抗拒。
小说版里航程是前往小笠原群岛，动画目的地改为冲绳。
追加客船于无人岛暂做停留，记者赤井义和被杀的情节。
原作为逼出真凶而假扮挟持水崎的人是中村，动画改为机关长大槻。
没有提起海上日志，追加香取洋子从船员那儿套出得知龙丸号与远东号相撞的真相。

冰点下15度的杀意

俵田孝太郎未登场。
没有美雪喝醉后的丑态，全员的聚会也改为喝普通饮料。

魔术列车杀人事件

删除开头金田一收到警视厅表彰，但却在明智恶作剧下当众播放AV而被撤回奖励的情节。
删除开头金田一和剑持外出找女警寻欢作乐，被美雪、和枝发现，因而金田一、剑持被两人打的情节。
动画版在发生两件命案后先行解开尸体移动与尸体消失之谜，夕海在这之后被杀。
解答篇时高远拿下自己眼镜后，将眼镜变做蔷薇。
左近寺个人魔术秀从夏季改为冬季，并且金田一一行人在魔术秀前并无与左近寺对话、樱庭也未登场。
删除结尾金田一和美雪看高远遥一假扮的魔术师在街边表演魔术、金田一用魔术偷走美雪胸罩的情节。

雪夜叉传说杀人事件

原作中是明智初登场，动画中明智已经登场、见到金田一多次。
为演出“大惊吓”而伪装被毒杀，原作中金田一演出成功、被导演比留田雅志等人称赞，动画则被加纳理惠识破、因此被比留田和栋方健责怪。
美雪于动画版有来到背冰村，与玲香的争风吃醋战提前开打，但两人也有短暂交谈心事。
明智与剑持来到冰室宅邸是因为迷路。
删去玲香为在加纳理惠面前不示弱而抽烟的情节。
删去明石道夫等人偷窥玲香称体重、加纳理惠换衣服（后被加纳察觉而摄像头被破坏）的情节。
响史郎在原作中不屑于明石等人对加纳的恶整、对民俗传说也有了解，动画则改为乐于和明石等人一起恶整加纳、更多是在调录像上协助。
加纳理惠被杀时间是凌晨两点前后，原作是五点前后。
明智的形象比原作提升不少。明智发现明石道夫尸体后没跟剑持打赌、也没把玲香视为凶手。
原作中玲香对于金田一产生好感是因为金田一帮自己洗脱冤屈，动画则无此因素、基本只是钦佩金田一的推理能力。
删去测试小型空中缆车的情节，更也没有背冰村无法全天供电的说词。
删去玲香提及大门自夸是跳远选手的说词。
追加大门发现栋方睡觉时穿女式睡衣时大吃一惊的情节。
金田一发现水沼也是左撇子的剪刀，其包装上面的标识，原作中是“含消费税”，动画版改为“消费税5%”。
金田一指出真正凶手的时机，原作在谈到10年前飞机失事幸存者名单之前，动画则在之后。
金田一要跨过河道展示作案手法时，明智在原作对金田一很焦急地喊话、要他别做傻事，动画则相信金田一不会做自己没把握的事、拦住要上前阻止金田一过河的玲香。
原作剑持充分信任金田一、相信自己开车能够安全过冰桥，动画则在实作成功前害怕冰桥垮掉、自己掉进河里。
动画版中凶手被设定为背冰村出身，并且是美雪询问杀人动机。
追加凶手朝当年坠机地点长起来的树砸雪球，以及美雪与凶手共情而做雪球给凶手来砸的情节。
事件结束后金田一没有到拘留所与凶手会面，而改为在凶手上直升机前劝喻凶手。
原作结尾时金田一收到美雪和玲香赠送的巧克力，动画则只收到玲香的，美雪心想不能小看玲香。

塔罗山庄杀人事件

美雪和玲香已经在雪夜叉事件见过面，因此在动画中美雪也受邀前往塔罗山庄。
删去速水雄一郎扯掉伊丹五郎和北条安妮相机胶卷（因拍到玲香拥抱金田一）作为两人入住条件的情节。
诹访正子更名为井上正子。
动画版中玲香有故意叫错美雪名字为“泉”和“美铃”。
美雪和玲香、金田一（乃至和小城拓也、辻健二）的情感相关互动相比原作有较大改动。
结城英作未登场，会塔罗牌占卜的人改为北条安妮，帮忙看火的人改为辻健二。
删去北条谈到塔罗牌中有一张表示下毒、因而不想吃饭的情节。
删去金田一检视所有人后，却发现只有自己没有不在场证明的情节。
删去诹访正子进入玲香房间，安慰被赤间光彦胁迫的玲香的情节。
大幅压抑赤间光彦对于玲香的商品化、性幻想相关情节。
删去小城拓也质问金田一如何将自己破案经历写入未来找工作履历，以及谈及自己不能打领带而求职碰壁的情节。
删去事件结束后玲香谈到自己重振继续当明星的想法，记者争相在游乐场寻找玲香，以及金田一遇见北条的情节。

黑死蝶杀人事件

删除开头金田一和美雪、玲香在沙滩游玩，以及后来金田一脚踏两条船自食苦果的情节。
五木阅读杂志发现深山日影，原作是在家中（都筑瑞穗有登场），动画是在一间餐厅（瑞穗未登场）。
金田一的舅舅，金田一丙助与表妹，金田一二三初登场。
删除斑目馆羽想割腕被绿女士阻止的情节。
斑目紫纹没有被切断手臂。
小野寺将之拿刀自杀是先跑进仓库找刀子，原作是拿起客厅中壁挂的展示用刀。
事后金田一等人没有参加深山与扬羽的婚礼，是从寄来的相片得知。
金田一二三搬来金田一家住的情节，从原作的《魔犬森林杀人事件》移到本案。

速水玲香诱拐杀人事件

原作案发时间为9月份，动画则是5月份。
事件开始时小渊泽有给玲香送上蔷薇花束。
金田一二三登场，也是第一次、迄今唯一一次实际与高远遥一见面。
二三在动画里帮了不少忙︰替金田一传话给剑持（漫画是一个不知名的小男孩）、发现玲香的鞋子上没有刮痕。
没有提到镝木叶子癌症末期一事。

佛兰西银币杀人事件

金田一二三登场。
追加金田一，美雪与二三一起玩"三人行"的情节。
追加美雪向二三介绍高森益美的情节。
追加二三因为金田一和美雪瞒着她自己去法兰西馆参加益美的时装秀而生气并诅咒金田一的情节。
原作里金田一和美雪有喝到葡萄酒，动画里则被酒保弓削透察觉是未成年人因而只喝到橙汁。
长岛警部、葛莱梅伯爵未登场。
弓削透发现罗曼尼康帝瓶子里装的是廉价葡萄酒的契机，从为金田一和美雪斟酒，改为接到其他客人投诉。
删去苏姬星河企图杀死奈绪子而被金田一阻止劝导的情节。
删去金田一推测君泽由理惠30年前有过类似如今高森益美和鸟丸奈绪子9年前经历的事的情节。
删去弓削透到监狱探望鸟丸奈绪子且记错她的生日的情节。
剑持告诉益美说广志其实是被奈绪子杀害，原作是告知金田一。
事件结尾描写不同，在原作是经明智警视同意而让益美参加小学同学会、动画版则是剑持私下让益美在小学同学面前再一次以模特身份站上舞台。